Kỹ thuật mô học thường quy nhuộm HE là một kỹ thuật cơ bản nhất giúp cho chẩn đoán mô bệnh học.

Các trường hợp được sinh thiết nội soi, bệnh phẩm phẫu thuật cần có chẩn đoán mô bệnh học

1. Quy trình chuyển bệnh phẩm bằng tay
Áp dụng cho các bệnh phẩm có chiều dày < 2 mm:
- Cồn 900 15 phút
- Cồn 950 15 phút
- Cồn 1000 I 15 phút
- Cồn 1000 II 15 phút
- Cồn 1000 III 15 phút
- Xylen I 15 phút
- Xylen II 30 phút
- Xylen III 30 phút
- Paraffin I 30 phút
- Paraffin II 1 giờ
- Paraffin III 1 giờ.
Chú ý : Bệnh phẩm phải lắc liên tục và hoá chất phải mới.
Áp dụng cho các bệnh phẩm dày 5 - 8 mm:
- Cồn 800 2 giờ
- Cồn 900 6 giờ
- Cồn 950 8 giờ
- Cồn 1000 I 4 giờ
- Cồn 1000 II 6 giờ
- Cồn 1000 III 8 giờ

- Xylen I 4 giờ
- Xylen II 8 giờ
- Xylen III 10 giờ
- Paraffin I 4 giờ
- Paraffin II 6 giờ
- Paraffin III
2. Quy trình chuyển máy 10 giờ
Áp dụng cho các mảnh sinh thiết và các mảnh mô nhỏ:
Thời gian cố định tối thiểu 3 giờ.
- Rửa nhẹ trong nước chảy.
- Cồn 800 10 phút
- Cồn 950 3 lần x 15 phút /lần
- Cồn 1000 3 lần x 15 phút /lần
- Cồn 1000/xylen t  lệ 1/1 15 phút
- Xylen 2 lần x 15 phút /lần
- Paraffin 3 lần x 15 phút /lần (*)
- Paraffin trong hút chân không từ 15 - 20‘. Nếu không có hút chân không ở thì (*) tăng thêm mỗi lần 5‘
- Đúc bloc.
Áp dụng cho các mô thông thường:
- Cồn 800 1 giờ
- Cồn 950 3 lần x 1 giờ /lần
- Cồn 1000 3 lần x 1 giờ /lần
- Xylen 3 lần x 1 giờ /lần
- Paraffin 3 lần x 1 giờ /lần
- Paraffin trong hút chân không 1 giờ
- Đúc bloc.
Vùi và đúc bloc:
Mục đích: Tạo khuôn cho bệnh phẩm để khi cắt không làm biến dạng tế bào và cấu trúc của chúng. Chất được dùng làm khuôn phổ biến nhất là paraffin có nhiệt độ nóng chảy phù hợp từ 56 - 580C.
Có 2 yêu cầu cơ bản:
+ Bệnh phẩm định hướng mô học đúng.
+ Thao tác nhanh để bệnh phẩm, paraffin và cassette gắn kết vững chắc.
3. Kỹ thuật cắt và dán mảnh
Dao cắt. Yêu cầu:
- Sắc
- Không sước hoặc mẻ
Một số điều kiện để cắt tốt:
- Nhiệt độ phòng cắt 250C
- Độ nghiêng lưỡi dao 450
Dán mảnh cắt: Thường dùng albumin với độ pha loãng 2% và hơ nóng dưới 500C.
4. Nhuộm
Trong kỹ thuật mô học, người ta có thể sử dụng cùng lúc nhiều loại phẩm nhuộm khác nhau để nhuộm nhiều chất hay nhiều thành phần khác nhau có trong một mô với nguyên tắc cơ bản là: Các phẩm nhuộm phải bắt màu chọn lọc trên từng chất hoặc trên từng thành phần mà không cản trở sự bắt màu của phẩm nhuộm thứ hai.
Một nguyên tắc nữa trong kỹ thuật mô học cũng cần đề cập một nguyên tắc nữa là nhuộm tương phản:
- Xanh - Đỏ
- Đỏ - Đen, v.v...
Phương pháp nhuộm hematoxylin-eosin chuẩn cho mảnh cắt Paraffin
4.1. Nguyên tắc: Là phương pháp nhuộm phối hợp thông dụng nhất bằng cách
nhuộm kế tiếp một phẩm nhuộm ―bazơ‖ - hematein và một phẩm nhuộm bào tương
―axit‖ - eosin.
Việc nhuộm nhân được nhuộm ―tăng dần‖ người ta dừng lại khi những cấu trúc của  nhân  r   nét  nhất.  Ngược  lại  với  việc  nhuộm bào  tương  ―giảm dần‖  bằng  cách nhuộm sẫm lên rồi loại phẩm thừa bằng cồn có độ thấp.
4.2. Tiến hành
- Tiêu bản tẩy paraffin trong 3 lần xylen, mỗi lần 2 phút
- Loại xylen bằng cồn 1000, cồn 950 mỗi lần 2 phút
- Rửa nước chảy 5 phút
- Loại các sắc tố do thuốc cố định nếu bệnh phẩm được cố định trong các dung dịch cố định có thu ngân (HgClơ2) hoặc Crom (Cr2O3) v.v... Sau đó rửa nước chảy 5 phút.
- Nhuộm nhân trong một dung dịch Alum hematoxylin tuỳ ý với thời gian thay đổi tuỳ từng loại thuốc nhuộm.
- Rửa kỹ trong nước chảy cho tới khi mảnh cắt có màu xanh thường từ 5 phút hoặc lâu hơn.
- Biệt hoá trong cồn acid 1 (1ml HCl nguyên chất trong 100 ml cồn 700)
- Rửa kỹ trong nước chảy cho tới khi mảnh cắt có màu xanh trở lại (10 - 15 phút) hoặc nhúng trong một dung dịch kiềm (nước ammoniac loãng) khoảng 5 phút rồi rửa nước.
- Nhuộm trong dung dịch Eosin Y 1 10 phút.
- Rửa nước chảy 1 - 5 phút.
- Tẩy nước bằng cồn tuyệt đối, làm trong và gắn lamelle.
Kết quả
- Nhân tế bào xanh/đen
- Bào tương thay đổi từ hồng đến hồng sẫm
- Các sợi cơ hồng sẫm đến đỏ
- Hồng cầu vàng da cam hoặc đỏ
- Các sợi fibrin hồng thẫm
Giới thiệu một số dung dịch hematoxylin và thời gian nhuộm. Cole‘s 20- 45 phút
Delafield‘s 15 - 20 phút
Ehrlich‘s Mayer‘s (tăng dần) 20 - 45 phút
Mayer‘s (tăng dần) 10 - 20 phút
Mayer‘s (giảm dần) 5 - 10 phút
Harris‘s (tăng dần khi nhuộm tế bào) 4 - 30 phút
Harris‘s (giảm dần) 5 - 15 phút
Gill‘s (giảm dần) 5 - 15 phút
Tiêu chuẩn của một tiêu bản cắt nhuộm HE đạt yêu cầu
- Mảnh cắt mỏng đều, không gấp, xước hoặc rách
- Kích thước của mảnh cắt to gần bằng thật
- Hơ không giãn quá
- Nhân tế bào có màu xanh đến xanh đen
- Bào tương có màu từ hồng đến đỏ
- Hồng cầu màu da cam hoặc đỏ đậm
- Các sợi cơ hồng đến đỏ
- Không bị ám nước
- Không có bọt khí