Tra cứu  ›  QTKT khám-chữa bệnh  ›  Treponema pallidum PCR

Treponema pallidum PCR

Quyết định số: 6769/QĐ-BYT

Ngày ban hành: 08/11/2018 12:00

Đại cương

1. Mục đích

Phát hiện sự có mặt bộ gen của Treponema pallidum có trong bệnh phẩm của người

2. Nguyên lý

Dựa trên nguyên lý kỹ thuật PCR.

Chuẩn bị

1. Người thực hiện

- Người thực hiện: Nhân viên xét nghiệm đã được đào tạo và có chứng chỉ hoặc chứng nhận về chuyên ngành Vi sinh (và/hoặc sinh học phân tử/ sinh học/công nghệ sinh học).

- Người nhận định và phê duyệt kết quả: Người thực hiện có trình độ đại học hoặc sau đại học về chuyên ngành Vi sinh (và/hoặc sinh học phân tử/ sinh học/công nghệ sinh học).

2. Phương tiện, hóa chất (Ví dụ hoặc tương đương)

2.1. Trang thiết bị

- Tủ an toàn sinh học cấp 2

- Máy ủ nhiệt

- Máy ly tâm > 12000 gpm/phút

- Máy ly tâm dùng cho tube 0,2 ml

- Máy vortex

- Máy chạy PCR

- Các loại Micropipette điều chỉnh được: 1000µl, 200µl, 100µl, 10µl

- Máy điện di

- Máy đọc ảnh gel

- Lò vi sóng

- Tủ lạnh thường

- Tủ âm sâu (20°C) hoặc (-70°C) (nếu có)

- Bộ lưu điện

2.2. Dụng cụ, hóa chất và vật tư tiêu hao (bao gồm nội kiểm, ngoại kiểm)

STT

Chi phí hóa chất, vật tư tiêu hao

Đơn vị

1

Dụng cụ lấy bệnh phẩm

Ống

2

Khay đựng bệnh phẩm

Cái

3

Hộp vận chuyển bệnh phẩm

Cái

4

Găng không có bột (DNase-RNase free)

Đôi

5

Sinh phẩm chẩn đoán

Test

6

Khấu hao sinh phẩm cho mẫu chứng các loại, kiểm tra chất lượng

Test

7

Kit tách chiết DNA/RNA

Test

8

Ống Eppendorf 1,5 ml

Tube

9

Ống Eppendorf 0,2 ml

Tube

10

Đầu côn 10 ul có lọc

Cái

11

Đầu côn 30 ul

Cái

12

Đầu côn 200 ul có lọc

Cái

13

Đầu côn 1 ml có lọc

Cái

14

Ethanol BDH

ml

15

Water-DEPC Treated

ml

16

Thạch

Gram

17

Ladder

ml

18

Blue Juice Gel loading dye

ml

19

Ethidium Bromide (hoặc Redgel)

ml

20

TAE Buffer

ml

21

Dung dịch khử trùng

ml

22

Sổ lưu kết quả xét nghiệm

Quyển

23

Giấy xét nghiệm

Tờ

25

Bút viết kính, bút bi, diêm

Cái

26

Xà phòng

Bánh

27

Khăn lau tay

Cái

28

Bông, cồn

Túi

29

Nước muối sinh lý

ml

30

Hộp lưu bệnh phẩm

Cái

31

Quần áo bảo hộ

Bộ

32

Cái

33

Khẩu trang

Cái

34

Găng tay xử lý dụng cụ

Đôi

35

Giấy thấm

Cuộn

36

Ngoại kiểm EQAS (nếu thực hiện)*

 

* Ghi chú: Chi phí ngoại kiểm cho quy trình kỹ thuật được tính cụ thể theo Chương trình ngoại kiểm (EQAS) là 1/200 tổng chi phí dụng cụ, hóa chất, vật tư tiêu hao (với số lần ngoại kiểm trung bình 2 lần/1 năm).

3. Bệnh phẩm

Dịch cơ thể nghi ngờ có căn nguyên do Treponema pallidum gây bệnh: Tổn thương loét, đào ban, vết trợt, hạch…

4. Phiếu xét nghiệm

Điền đầy đủ thông tin theo mẫu phiếu yêu cầu

Các bước tiến hành

Các bước tiến hành thực hiện theo phương tiện, hóa chất được ví dụ trên.

1. Lấy bệnh phẩm

Theo đúng quy định của chuyên ngành Vi sinh (Xem Phụ lục).

2. Tiến hành kỹ thuật

2.1. Tách chiết DNA từ bệnh phẩm

2.2. Pha hỗn hợp phản ứng PCR

2.3. Chạy phản ứng PCR

2.4. Điện di sản phẩm PCR

2.5. Đọc kết quả

Tai biến và xử trí

- Phản ứng dương tính giả: do tạp nhiễm từ môi trường

- Phản ứng âm tính giả: do phản ứng PCR bị ức chế

- Để hạn chế các hiện tượng trên phải tuân thủ chặt chẽ quy trình kỹ thuật.