Hệ thống thông tin Sức khỏe Việt

- Người thực hiện: Người thực hiện đã được đào tạo và có chứng chỉ hoặc chứng nhận về chuyên ngành Vi sinh hoặc chuyên ngành tương đương (và/hoặc sinh học phân tử/ sinh học/công nghệ sinh học).

- Người nhận định và phê duyệt kết quả: Người thực hiện có trình độ đại học hoặc sau đại học về chuyên ngành Vi sinh (và/hoặc sinh học phân tử/ sinh học/công nghệ sinh học).

2. Phương tiện, hóa chất

2.3 Trang thiết bị

- Tủ an toàn sinh học cấp 2

- Tủ thao tác PCR (PCR Workstation)

- Máy PCR

- Hệ thống điện di

- Máy giải trình tự gen

- Máy ly tâm 25000 x g

- Máy ủ nhiệt

- Máy vortex

- Pipette

- Tủ đông sâu (-20°Cvà -70°C)

- Máy vi tính và phần mềm phân tích trình tự

2.4 Dụng cụ, hóa chất và vật tư tiêu hao (bao gồm nội kiểm, ngoại kiểm)

STT	Chi phí hóa chất, vật tư tiêu hao	Đơn vị
1	Bông	kg
2	Cồn	ml
3	Bơm kim tiêm	Cái
4	Panh	Cái
5	Khay đựng bệnh phẩm	Cái
6	Hộp vận chuyển bệnh phẩm	Test
7	Tube đựng bệnh phẩm	Cái
8	Găng không có bột (DNase-RNase free)	Cái
9	PCR master mix	Test
10	Men Polymerase hoặc Taq Polymerase	ml
11	Khấu hao sinh phẩm cho chẩn đoán và kiểm tra chất lượng	Test
12	Kit tách chiết ADN/ARN	Test
13	Kit tinh sạch DNA sau PCR	Test
14	Kit tinh sạch sản phẩm sau nhuộm màu (sau PCR sequencing)	Test
15	DNA marker	Bộ
16	Primer 1 (primer đặc hiệu)	ml
17	Primer 2 (primer đặc hiệu)	ml
18	Primer 3 (primer đặc hiệu)	ml
19	Primer 4 (primer đặc hiệu)	ml
20	Kit nhuộm màu trình tự (Big dye) - PCR sequencing	Test
21	Plate/tube cho máy đọc trình tự	Cái
22	Gel điện di cho máy đọc trình tự	Gram
23	Cartrigde cho máy đọc trình tự	Test
24	Ống Eppendorf 1,5 ml	Tube
25	Ống Eppendorf 0,2 ml	Tube
26	Đầu côn 10 ul có lọc	Cái
27	Đầu côn 30 ul có lọc	Cái
28	Đầu côn 200 ul có lọc	Cái
29	Đầu côn 1 ml có lọc	Cái
30	Ethanol BDH	ml
31	Water-DEPC Treated	ml
32	Giấy thấm	Cuộn
33	Giấy xét nghiệm	Tờ
34	Sổ lưu kết quả xét nghiệm	Tờ
35	Bút viết kính	Cái
36	Bút bi	Cái
37	Mũ	Cái
38	Khẩu trang	Cái
39	Găng tay	Đôi
40	Găng tay xử lý dụng cụ	Đôi
41	Quần áo	Bộ
42	Dung dịch nước rửa tay	ml
43	Cồn sát trùng tay nhanh	ml
44	Dung dịch khử trùng	ml
45	Khăn lau tay	cái

3. Bệnhphẩm

Bệnh phẩm cơ thể có chứa căn nguyên virus nghi ngờ

4. Phiếu xét nghiệm

Điền đầy đủ thông tin theo mẫu phiếu yêu cầu

Các bước tiến hành

1. Lấy bệnh phẩm

Theo đúng quy định của chuyên ngành Vi sinh (Xem phụ lục).

2. Tiến hành kỹ thuật

2.1 Tách chiết DNA/RNA tổng số

2.2 Thực hiện PCR

2.3 Điện di kiểm tra sản phẩm

2.4 Giải trình tự gen

2.5 Kiểm tra và so sánh trình tự gen trên ngân hàng dữ liệu gen quốc tế

3. Thời gian thực hiện: 2 - 5 ngày

Tai biến và xử trí

- Trong trường hợp không có sản phẩm PCR, cần phải kiểm tra lại quá trình tách chiết DNA tổng số, chất lượng của primers và master mix, và thực hiện lại toàn bộ xét nghiệm.

- Nếu trình tự DNA bị nhiễu cần phải kiểm tra lại độ đặc hiệu của sản phẩm PCR hoặc quá trình chạy PCR sequencing bị nhiễm chéo.