Tra cứu  ›  QTKT khám-chữa bệnh  ›  Rotavirus PCR

Rotavirus PCR

Quyết định số: 6769/QĐ-BYT

Ngày ban hành: 08/11/2018 12:00

Đại cương

1. Mục đích

Phát hiện sự có mặt bộ gen của Rotavirus có trong phân của người .

2. Nguyên lý

Dựa trên nguyên lý kỹ thuật PCR.

Chuẩn bị

1. Người thực hiện

- Người thực hiện: Nhân viên xét nghiệm đã được đào tạo và có chứng chỉ hoặc chứng nhận về chuyên ngành Vi sinh (và/hoặc sinh học phân tử/ sinh học/công nghệ sinh học).

- Người nhận định và phê duyệt kết quả: Người thực hiện có trình độ đại học hoặc sau đại học về chuyên ngành Vi sinh (và/hoặc sinh học phân tử/ sinh học/công nghệ sinh học).

2. Phương tiện, hóa chất (Ví dụ hoặc tương đương)

2.1. Trang thiết bị

- Tủ an toàn sinh học tối thiểu cấp 2

- Máy nhiệt

- Máy ly tâm ≥ 12000 gpm/phút

- Máy ly tâm dùng cho tube 0,2 ml

- Máy vortex

- Máy chạy PCR

- Các loại Micropipette điều chỉnh được: 1000µl, 200µl, 100µl, 10µl

- Máy điện di

- Máy đọc ảnh gel

- Lò vi sóng

- Tủ lạnh thường

- Tủ âm sâu (20°C) hoặc (-70°C) (nếu có)

- Bộ lưu điện

2.2. Dụng cụ, hóa chất và vật tư tiêu hao (bao gồm nội kiểm, ngoại kiểm)

STT

Chi phí hóa chất, vật tư tiêu hao

Đơn vị

1

Giấy xét nghiệm

Tờ

2

Dụng cụ lấy bệnh phẩm

Que

3

Lọ nhựa đựng bệnh phẩm

Cái

4

Găng không có bột (DNase-RNase free)

Đôi

5

Khay đựng bệnh phẩm

Cái

6

Hộp vận chuyển bệnh phẩm

Cái

7

Sinh phẩm chẩn đoán

 

8

Khấu hao sinh phẩm cho chạy chứng và kiểm tra chất lượng

Test

9

Hóa chất và VTTH cho tách chiết trên máy MPLC

Test

10

Ống nhựa Eppendorf 1.7 ml

ống

11

PBS Buffer

mL

12

Absolute Ethanol

mL

13

UltraPure DNase/RNase Distilled Water

mL

14

Ultrapure Agarose

Gram

15

Ultrapure TBE Buffer 10X

mL

16

100bp DNA ladder (Đóng gói 50 ug)

μl

17

10X BlueJuice Gel Loading dye

Đóng gói 3x1ml

μl

18

Utrapure 10mg/ml Ethidium Bromide

μl

19

ống PCR 0,2 ml, nắp phẳng

Cái

20

Đầu côn 1000 μl có lọc

Cái

21

Đầu côn 200 μl có lọc

Cái

22

Đầu côn 0,2-10 µl có lọc

Cái

23

Giấy thấm không bụi

Cuộn

24

Giấy xét nghiệm

Tờ

25

Sổ lưu kết quả xét nghiệm

Tờ

26

Bút viết kính

Cái

27

Bút bi

Cái

28

Cái

29

Khẩu trang

Cái

30

Găng tay

Đôi

31

Găng tay xử lý dụng cụ

Đôi

32

Quần áo bảo hộ

Bộ

33

Dung dịch xà phòng rửa tay

ml

34

Cồn sát trùng tay nhanh

ml

35

Dung dịch khử trùng

ml

36

Khăn lau tay

Cái

37

EQAS (nếu thực hiện)*

 

* Ghi chú:

- Chi phí ngoại kiểm cho quy trình kỹ thuật được tính cụ thể theo Chương trình ngoại kiểm (EQAS) là 1/50 tổng chi phí dụng cụ, hóa chất, vật tư tiêu hao (với số lần ngoại kiểm trung bình 2 lần/1 năm).

3. Bệnh phẩm

Phân.

4. Phiếu xét nghiệm

Điền đầy đủ thông tin theo mẫu phiếu yêu cầu

Các bước tiến hành

Các bước tiến hành thực hiện theo phương tiện, hóa chất được ví dụ ở trên.

1. Lấy bệnh phẩm

Theo đúng quy định của chuyên ngành Vi sinh (Xem Phụ lục).

2. Tiến hành kỹ thuật

2.1. Tách chiết DNA từ bệnh phẩm

2.2. Pha hỗn hợp phản ứng PCR

2.3. Chạy phản ứng PCR

2.4. Điện di sản phẩm PCR

2.5. Đọc kết quả

Tai biến và xử trí

- Phản ứng dương tính giả: do tạp nhiễm từ môi trường

- Phản ứng âm tính giả: do phản ứng PCR bị ức chế      

- Để hạn chế các hiện tượng trên phải tuân thủ chặt chẽ quy trình kỹ thuật.