Các bài viết liên quan
- NGHIỆM PHÁP COOMBS TRỰC TIẾP
- PHÁT HIỆN ĐẢO ĐOẠN INTRON 22 CỦA GEN YẾU TỐ VIII BỆNH HEMOPHILIA BẰNG KỸ THUẬT LONG-RANGE PCR
- ĐỊNH LƯỢNG VIRUS CYTOMEGALO (CMV) BẰNG KỸ THUẬT REAL-TIME PCR
- XÉT NGHIỆM PHÁT HIỆN ĐỘT BIẾN GEN BẰNG KỸ THUẬT MULTIPLEX PCR
- PHÁT HIỆN GEN JAK2 V617F BẰNG KỸ THUẬT AS-PCR
- XÉT NGHIỆM PHÁT HIỆN SỰ TỒN TẠI CỦA GEN BỆNH BẰNG KỸ THUẬT RT-PCR
- ĐỊNH LƯỢNG GEN BỆNH MÁU ÁC TÍNH BẰNG KỸ THUẬT REALTIME PCR
- KỸ THUẬT NESTED RT-PCR PHÁT HIỆN GEN LAI BCR/ABL
- TÁCH CHIẾT ARN TỪ MÁU NGOẠI VI/TỦY XƯƠNG
- TÁCH CHIẾT ADN TỪ MÁU NGOẠI VI/MÁU CUỐNG RỐN
PCR CHẨN ĐOÁN BỆNH ALPHA THALASSEMIA (05 ĐỘT BIẾN)
Quyết định số: 2017/QĐ-BYT
Ngày ban hành: 09/06/2014 12:00
Đại cương
Phản ứng tổng hợp chuỗi (PCR) là phản ứng cho phép nhân bản chính xác
một trình tự ADN quan tâm lên hàng triệu lần. Sử dụng phương pháp PCR thông
thường với một cặp mồi đặc trưng chỉ phát hiện được một đột biến. Để phát hiện
nhiều hơn một đột biến sẽ phải làm nhiều xét nghiệm PCR. Có rất nhiều loại đột
biến gây bệnh anpha Thalassemia. Trong trường hợp này sử dụng kỹ thuật
Multiplex PCR là giải pháp tối ưu. Đây là phương pháp sử dụng nhiều cặp mồi
trong cùng một phản ứng PCR. Như vậy chỉ cần một phản ứng Multiplex PCR
chúng ta đã có thể phát hiện được nhiều đột biến cùng một lúc.
Chỉ định điều trị
Sử dụng cho tất cả người bệnh có chẩn đoán Alpha-Thalassemia.
Chống chỉ định
Không có chống chỉ định.
Chuẩn bị
1. Ngƣời thực hiện
Kỹ thuật viên xét nghiệm sinh học phân tử đã được đào tạo.
2. Phƣơng tiện - Hóa chất
2.1. Phương tiện
- Máy PCR;
- Hệ thống máy điện di, hệ thống đèn cực tím soi gel, hệ thống máy chụp
ảnh;
- Buồng vô trùng (biology cabinet);
- Máy ly tâm tốc độ cao (tốc độ tối đa 14.000 vòng/phút);
- Máy vortex;
- Các loại pipet 10 µl, 20 µl, 100 µl, 200 µl, 1000 µl;
- Đầu côn có màng lọc;
- Ống eppendorf 1,5 ml vô trùng, không có enzym nucleaza;
- Ống PCR 0,2 ml vô trùng, không có enzym nucleaza;
- Tủ lạnh 4-80C, tủ âm sâu -200C;
- Găng tay.
174
2.2. Hóa chất
- Kit tách ADN thương mại hoặc các hóa chất cần thiết cho tách chiết thủ
công ADN (proteinase K, đệm ly giải tế bào, phenol/chloroform, cồn tuyệt đối).
- Hóa chất chạy PCR gồm: Đệm, MgCl2, dNTPs, enzym kéo dài chuỗi,
nước khử ion vô trùng.
- Các mồi đặc hiệu gồm 12 mồi để xác định đồng thời 5 đột biến mất
đoạn; đồng thời cho biết tính đồng hợp, dị hợp tử đột biến và 1 cặp mồi sử dụng
làm chứng nội kiểm (Internal control). Theo bảng sau:
Mồi | Trình tự |
SEA CF | 5’ - CTC TGT GTT CTC CAG TAT TGG AGG GAA GGA G - 3’ |
SEA NR | 5’ - TGA AGA GCC TGC AGG ACC AGG TCA GTG ACC G - 3’ |
SEA MR | 5’ - ATA TAT GGG TCT GGA AGT GTA TCC CTC CCA - 3’ |
FIL MF | 5’ - AAG AGA ATA AAC CAC CCA ATT TTT AAA TGG GCA - 3’ |
FIL MR | 5’ - GAG ATA ATA ACC TTT ATC TGC CAC ATG TAG CAA - 3’ |
THAI MF | 5’ - CAC GAG TAA AAC ATC AAG TAC ACT CCA GCC - 3’ |
THAI MR | 5’ - TGG ATC TGC ACC TCT TGG GTA GGT TCT CTA CC - 3’ |
α2/3.7 F | 5’ - CCC CTC GCC AAG TCC ACC C - 3’ |
3.7/20.5R | 5’ - AAA GCA CTC TGA GGG TCC AGC G - 3’ |
α2 R | 5’ - AGA CCA GGA AGG GCC GGT G - 3’ |
4.2 R | 5’ - CCC GTT GGA TCT TCT CAT TTC CC - 3’ |
4.2 F | 5’ - GGT TTA CCC ATG TGG TGC CTC - 3’ |
- Thạch agarose, đệm tra mẫu, thang chuẩn ADN.
- Thuốc nhuộm ethidium bromide.
3. Bệnh phẩm
2 ml máu ngoại vi đựng trong ống chống đông EDTA.
4. Phiếu xét nghiệm
Có đầy đủ các thông tin cần thiết về người bệnh, về chẩn đoán và yêu cầu
xét nghiệm.
Các bước tiến hành
1. Lấy bệnh phẩm
2 ml máu ngoại vi chống đông bằng EDTA.
2. Tiến hành kỹ thuật
2.1. Tách chiết ADN
Xem bài “ Tách chiết ADN từ máu ngoại vi”
175
2.2. Thực hiện phản ứng Multiplex PCR phát hiện 5 đột biến bệnh alpha
thalassaemia.
STT | Sinh phẩm | Thành phần (µl)/1 pứ |
1 | H2O | 5,5 |
2 | 2X GoTaq Green MM | 12,5 |
3 | DMSO | 1,0 |
4 | Hỗn hợp mồi | 5,0 |
5 | DNA | 1,0 |
Tổng thể tích | 25,0 |
- Ly tâm nhẹ để các thành phần lắng xuống đáy ống hoàn toàn
- Đặt vào máy PCR
- Chọn chương trình
- Bấm start để máy chạy
2.3 Điện di sản phẩm PCR
2.3.1. Chuẩn bị gel agarose
- Cân 1 g agarose cho vào bình thủy tinh chịu nhiệt.
- Thêm 100 ml đệm điện di (TAE 1X /TBE 1X...) vào bình, lắc đều.
- Đun mỗi lần 1 phút trong lò vi sóng đến khi agarose tan hoàn toàn.
- Để ấm đến 600 rồi đổ vào khay đã cắm lược.
- Để nhiệt độ phòng 30 phút để thạch đông rồi mới rút lược ra.
2.3.2. Điện di
- Lấy 5 µl sản phẩm PCR + 1 µl đệm tra mẫu + 4 µl dH20
- Trộn đều và nhỏ vào các giếng theo thứ tự
- Nhỏ 3 µl marker ADN vào giếng kế tiếp
- Đặt bản gel vào máy điện di
- Đổ đệm điện di ngập bản gel và chạy ở 100 V trong 20 phút
- Nhuộm bản gel với dung dịch ethidium bromide trong 5 phút
Tai biến và xử trí
Lấy mẫu không đủ hoặc sai chất chống đông. | Thực hiện theo đúng hướng dẫn qui cách lấy mẫu. |
176
Thao tác pipet không chính xác. | Sử dụng pipet theo đúng thể tích quy định. |
Tín hiệu phản ứng không rõ ràng. | Bảo quản hóa chất đúng theo khuyến cáo của nhà sản xuất Thực hiện đúng, đủ các bước trong quy trình xét nghiệm. |
Tài liệu tham khảo
1. Chong et al., Single-tube multiplex-PCR screen for common deletional
determinants of a-thalassemia. Blood 2000;95:360–362.
2. Old JM DNA-based diagnosis of the hemoglobin disorders. In: Steinberg MH,
Forget PG, Higgs DR, Nagel RL (eds) Disorders of Hemoglobin: Genetics,
Pathophysiology, and Clinical Management. Cambridge University Press,
Cambridge, UK(2001). pp 941-57